De beide langdoornige soorten zijn erg lastig van elkaar te onderscheiden. Het zanddoorntje is vaak wat bonter gekleurd dan het zeggedoorntje, dat meestal egaal bruin is.

Daarnaast heeft de middendij van het zanddoorntje vaak een iets golvende rand. Het belangrijkste kenmerk is de knik in de kiel bovenop de achterdij. Bij het zeggedoorntje ontbreekt de knik. Op de foto (die groter wordt als je erop klikt) is het verschil aangegeven.